| 2001 | 5092 | Instituto de Verbologia Hispánica |  | 6543 | 3352 | 2538 | 3879 |
| 2002 | 315 | Instituto de Telecomunicações |  | 547 | 900 | 464 | 360 |
| 2003 | 6853 | Instituto de Tecnologias Físicas y de la Información Leonardo Torres Quevedo ITEFI | | 3420 | 7819 | 2538 | 3191 |
| 2004 | 2717 | Instituto de Tecnologías Educativas (Formación y Recursos en Red para el Profesorado) | | 215 | 685 | 2538 | 3879 |
| 2005 | 1797 | Instituto de Tecnología Química | | 2291 | 3807 | 2538 | 1009 |
| 2006 | 3037 | Instituto de Tecnología Eléctrica | | 3243 | 2980 | 2538 | 3076 |
| 2007 | 4689 | Instituto de Tecnología de la Construcción de Cataluña | | 848 | 3282 | 2538 | 3879 |
| 2008 | 5066 | Instituto de Tecnología Cerámica | | 4394 | 6495 | 2538 | 3034 |
| 2009 | 3284 | Instituto de Soldadura e Qualidade | | 1724 | 2124 | 2538 | 3509 |
| 2010 | 7055 | Instituto de Síntesis Química y Catálisis Homogénea | | 5144 | 6478 | 2538 | 3879 |
| 2011 | 8054 | Instituto de Seguridad de la Información (Instituto de Física Aplicada) | | 7288 | 8044 | 2538 | 3879 |
| 2012 | 277 | Instituto de Salud Global Barcelona ISGLOBAL (Centro de Investigación en Salud Internacional de Barcelona CRESIB) | | 773 | 760 | 640 | 289 |
| 2013 | 98 | Instituto de Salud Carlos III | | 176 | 267 | 228 | 106 |
| 2014 | 2126 | Instituto de Robótica e Informática Industrial | | 821 | 6823 | 789 | 1339 |
| 2015 | 7357 | Instituto de Recursos Naturales y Agrobiología de Sevilla | | 4760 | 7636 | 2263 | 3879 |
| 2016 | 5533 | Instituto de Recursos Naturales y Agrobiología de Salamanca | | 4565 | 7747 | 2538 | 2266 |
| 2017 | 4912 | Instituto de Química Orgánica General | | 4223 | 7812 | 2538 | 1753 |
| 2018 | 3369 | Instituto de Química Médica | | 4011 | 7532 | 1804 | 1681 |
| 2019 | 2177 | Instituto de Química Física Rocasolano | | 1170 | 7093 | 581 | 1246 |
| 2020 | 1883 | Instituto de Química Avanzada de Cataluña / Institut de Química Avançada de Catalunya | | 4586 | 6036 | 945 | 1218 |
| 2021 | 3915 | Instituto de Productos Naturales y Agrobiologia | | 6024 | 7708 | 1160 | 2220 |
| 2022 | 3562 | Instituto de Productos Lácteos de Asturias | | 6067 | 7800 | 1614 | 1596 |
| 2023 | 3228 | Instituto de Patologia e Imunologia Molecular Universidade do Porto | | 2439 | 3481 | 322 | 3879 |
| 2024 | 3589 | Instituto de Parasitología y Biomedicina López Neyra | | 5474 | 7633 | 1900 | 1689 |
| 2025 | 7711 | Instituto de Optica Visual Optics and Biophotonics Lab | | 4250 | 7583 | 2538 | 3879 |
| 2026 | 3978 | Instituto de Óptica Daza de Valdés | | 4704 | 7121 | 2538 | 1689 |
| 2027 | 1979 | Instituto de Neurociencias de Alicante | | 3983 | 2570 | 2538 | 1992 |
| 2028 | 6826 | Instituto de Nanoestruturas, Nanomodelação e Nanofabrico | | 6190 | 6025 | 2538 | 3879 |
| 2029 | 2120 | Instituto de Microelectronica de Barcelona | | 3848 | 7491 | 780 | 616 |
| 2030 | 2376 | Instituto de Microcirugía Ocular de Barcelona | | 1282 | 2247 | 2538 | 2822 |
| 2031 | 5390 | Instituto de Micro y Nanotecnología (Instituto de Microelectrónica de Madrid) | | 6173 | 7841 | 2538 | 1975 |
| 2032 | 4217 | Instituto de Máquina Herramienta | | 1475 | 2453 | 2538 | 3879 |
| 2033 | 5285 | Instituto de Lenguas y Culturas del Mediterráneo y Oriente Próximo (Instituto de Filología) CCHS | | 3312 | 5443 | 2538 | 3509 |
| 2034 | 5250 | Instituto de la Lengua, Literatura y Antropología CCHS | | 3079 | 6000 | 2538 | 3316 |
| 2035 | 3978 | Instituto de la Ingeniería de España | | 5599 | 1766 | 2538 | 3879 |
| 2036 | 3237 | Instituto de la Grasa | | 5690 | 7551 | 1643 | 1501 |
| 2037 | 5471 | Instituto de la Construcción de Castilla y León | | 5637 | 3994 | 2538 | 3879 |
| 2038 | 6209 | Instituto de Investigaciones Químicas | | 3748 | 7895 | 2538 | 2584 |
| 2039 | 1513 | Instituto de Investigaciones Marinas | | 3930 | 4967 | 451 | 1409 |
| 2040 | 3669 | Instituto de Investigaciones Biomédicas de Barcelona | | 2592 | 7411 | 1007 | 2510 |
| 2041 | 690 | Instituto de Investigaciones Biomédicas August Pi i Sunyer | | 1418 | 1848 | 2538 | 112 |
| 2042 | 1951 | Instituto de Investigaciones Biomédicas Alberto Sols | | 2253 | 6548 | 575 | 1222 |
| 2043 | 6644 | Instituto de Investigaciones Agrobiológicas de Galicia | | 7672 | 7908 | 2538 | 2696 |
| 2044 | 3481 | Instituto de Investigación y Desarrollo Quimico-Biologico | | 1162 | 1379 | 2538 | 3879 |
| 2045 | 2150 | Instituto de Investigación Sanitaria Princesa | | 2792 | 4946 | 2538 | 1024 |
| 2046 | 1072 | Instituto de Investigación Sanitaria La Fe | | 1963 | 1709 | 1686 | 1649 |
| 2047 | 1527 | Instituto de Investigación Sanitaria INCLIVA | | 3312 | 3350 | 2538 | 749 |
| 2048 | 1132 | Instituto de Investigación Sanitaria IdiPAZ Hospital Universitario La Paz | | 2450 | 3647 | 1678 | 696 |
| 2049 | 1473 | Instituto de Investigación Sanitaria Gregorio Marañón | | 3614 | 4891 | 1764 | 850 |
| 2050 | 2086 | Instituto de Investigación Sanitaria del Hospital Clínico San Carlos | | 4187 | 4759 | 2538 | 967 |
| 2051 | 2408 | Instituto de Investigación Sanitaria de Santiago de Compostela | | 3636 | 4817 | 2538 | 1464 |
| 2052 | 2094 | Instituto de Investigación Hospital 12 de Octubre | | 4135 | 4764 | 2538 | 975 |
| 2053 | 2202 | Instituto de Investigación en Recursos Cinegéticos | | 4893 | 4813 | 2538 | 1074 |
| 2054 | 1375 | Instituto de Investigación en Inteligencia Artificial | | 794 | 4334 | 623 | 1473 |
| 2055 | 4736 | Instituto de Investigación en Ingeniería de Aragón | | 1553 | 3269 | 2538 | 3879 |
| 2056 | 4579 | Instituto de Investigación en Ciencias de Alimentación | | 5692 | 7527 | 2538 | 1753 |
| 2057 | 424 | Instituto de Investigación Biomédica de Barcelona | | 674 | 940 | 332 | 775 |
| 2058 | 2636 | Instituto de Investigación Biomédica de A Coruña | | 5206 | 4777 | 2538 | 1701 |
| 2059 | 5205 | Instituto de Instrumentación para Imagen Molecular | | 6656 | 7942 | 2260 | 2266 |
| 2060 | 5139 | Instituto de Innovación Empresarial de las Islas Baleares | | 4586 | 3584 | 2538 | 3879 |
| 2061 | 5533 | Instituto de Ingenieria del Conocimiento | | 4916 | 6834 | 2538 | 3076 |
| 2062 | 4213 | Instituto de Hortofruticultura Subtropical y Mediterranea La Mayora | | 5516 | 7333 | 2538 | 1681 |
| 2063 | 2710 | Instituto de Historia CCHS | | 659 | 4420 | 2538 | 2220 |
| 2064 | 4588 | Instituto de Hidráulica Ambiental | | 1553 | 3024 | 2538 | 3879 |
| 2065 | 2705 | Instituto de Gestión de la Innovación y del Conocimiento | | 1834 | 6896 | 1144 | 1934 |
| 2066 | 3417 | Instituto de Geociencias | | 3920 | 7469 | 2302 | 1445 |
| 2067 | 8116 | Instituto de Genética Medica Jacinto Magalhães | | 8091 | 8086 | 2538 | 3879 |
| 2068 | 4434 | Instituto de Formación e Investigación Marques de Valdecilla | | 4394 | 5067 | 2538 | 3252 |
| 2069 | 7044 | Instituto de Física Teórica | | 1535 | 6668 | 2538 | 3879 |
| 2070 | 1057 | Instituto de Física Interdisciplinar y Sistemas Complejos / Institute for Cross-Disciplinary Physics and Complex Systems | | 2078 | 2668 | 488 | 1508 |
| 2071 | 3528 | Instituto de Fisica Fundamental | | 4768 | 7603 | 1417 | 1934 |
| 2072 | 852 | Instituto de Física de Cantabria | | 4837 | 3442 | 779 | 427 |
| 2073 | 453 | Instituto de Física Corpuscular | | 1055 | 1895 | 535 | 279 |
| 2074 | 5650 | Instituto de Filosofía CCHS | | 2797 | 4490 | 2538 | 3879 |
| 2075 | 8038 | Instituto de Fermentaciones Industriales | | 7707 | 8004 | 2538 | 3879 |
| 2076 | 4795 | Instituto de Estudios Sociales Avanzados de Andalucía | | 2521 | 7544 | 1534 | 3076 |
| 2077 | 4754 | Instituto de Estudios Políticos para América Latina y África | | 2418 | 3222 | 2538 | 3879 |
| 2078 | 6921 | Instituto de Estudios Islámicos y del Oriente Próximo | | 6596 | 6167 | 2538 | 3879 |
| 2079 | 7737 | Instituto de Estudios Gallegos Padre Sarmiento | | 4605 | 7619 | 2538 | 3879 |
| 2080 | 3440 | Instituto de Estudios Fiscales | | 93 | 1572 | 2538 | 3879 |
| 2081 | 926 | Instituto de Estudios Espaciales de Cataluña | | 3532 | 2597 | 2296 | 416 |
| 2082 | 5016 | Instituto de Estudios del Huevo | | 7509 | 3095 | 2538 | 3879 |
| 2083 | 7192 | Instituto de Estudios de Medicina de Montaña | | 7954 | 6236 | 2538 | 3879 |
| 2084 | 3644 | Instituto de Estudios de Ciencias de la Salud de Castilla y León | | 2588 | 4669 | 2538 | 2981 |
| 2085 | 1483 | Instituto de Estudios Catalanes | | 133 | 456 | 2538 | 3076 |
| 2086 | 4228 | Instituto de Engenharia Eletrônica e Telemática de Aveiro | | 3486 | 2301 | 2538 | 3879 |
| 2087 | 2490 | Instituto de Engenharia de Sistemas e Computadores do Porto | | 818 | 1624 | 998 | 3879 |
| 2088 | 1829 | Instituto de Engenharia de Sistemas e Computadores | | 1016 | 751 | 528 | 3879 |
| 2089 | 6471 | Instituto de Endocrinología y Nutrición | | 4514 | 5591 | 2538 | 3879 |
| 2090 | 3788 | Instituto de Economía Geografía y Demografía CCHS | | 3257 | 5411 | 2538 | 2733 |
| 2091 | 1338 | Instituto de Diagnóstico Ambiental y Estudios del Agua | | 2530 | 6213 | 318 | 461 |
| 2092 | 3002 | Instituto de Desenvolvimento de Novas Tecnologias | | 4605 | 2237 | 1124 | 3879 |
| 2093 | 6314 | Instituto de Ciências Sociais da Universidade de Lisboa | | 1077 | 7257 | 1388 | 3879 |
| 2094 | 936 | Instituto de Ciencias Matematicas | | 1989 | 1790 | 1002 | 1508 |
| 2095 | 3773 | Instituto de Ciencias Marinas de Andalucía | | 6248 | 7639 | 1599 | 2002 |
| 2096 | 4395 | Instituto de Ciencias del Patrimonio | | 7719 | 7691 | 1395 | 2431 |
| 2097 | 7270 | Instituto de Ciencias del Corazón | | 5893 | 6801 | 2538 | 3879 |
| 2098 | 1823 | Instituto de Ciencias de la Vid y Vino | | 4916 | 4264 | 2065 | 1649 |
| 2099 | 2879 | Instituto de Ciencias de la Tierra Jaume Almera | | 1787 | 7436 | 718 | 1753 |
| 2100 | 2660 | Instituto de Ciencias de la Construcción Eduardo Torroja | | 3237 | 6619 | 1568 | 1843 |
