| 1 | 825 | Laboratório Nacional de Engenharia Civil | 534 | 1425 | 1038 | 1526 |
| 2 | 864 | Laboratorio Nacional de Energia e Geologia (Instituto Nacional de Engenharia Tecnologia e Inovação) | 1179 | 1823 | 827 | 1366 |
| 3 | 547 | Laboratório de Instrumentação e Física Experimental de Partículas | 2158 | 2224 | 994 | 291 |
| 4 | 3515 | Laboratório da Marinha Portuguesa | 1982 | 2090 | 2538 | 3660 |
| 5 | 858 | International Iberian Nanotechnology Laboratory | 4369 | 2071 | 522 | 1163 |
| 6 | 4806 | Instituto Tecnológico e Nuclear | 2799 | 3254 | 2538 | 3879 |
| 7 | 1136 | Instituto Portugués do Mar e da Atmosfera (Instituto de Meteorologia Portugal) | 1494 | 642 | 413 | 3191 |
| 8 | 4802 | Instituto Português de Reumatologia | 6342 | 5660 | 2538 | 3191 |
| 9 | 2307 | Instituto Português de Oncologia Porto | 3785 | 3780 | 2538 | 1856 |
| 10 | 4266 | Instituto Português de Oncologia Francisco Gentil Lisboa | 3880 | 7263 | 2385 | 2408 |
| 11 | 3715 | Instituto Pedro Nunes | 1817 | 1634 | 2538 | 3879 |
| 12 | 1426 | Instituto Nacional de Saúde Dr Ricardo Jorge | 1221 | 2298 | 2538 | 1113 |
| 13 | 7822 | Instituto Nacional de Medicina Legal e Ciencias Forenses | 5336 | 7739 | 2538 | 3879 |
| 14 | 1290 | Instituto Gulbenkian de Ciência | 1978 | 5037 | 445 | 877 |
| 15 | 315 | Instituto de Telecomunicações | 547 | 900 | 464 | 360 |
| 16 | 3284 | Instituto de Soldadura e Qualidade | 1724 | 2124 | 2538 | 3509 |
| 17 | 3228 | Instituto de Patologia e Imunologia Molecular Universidade do Porto | 2439 | 3481 | 322 | 3879 |
| 18 | 6826 | Instituto de Nanoestruturas, Nanomodelação e Nanofabrico | 6190 | 6025 | 2538 | 3879 |
| 19 | 8116 | Instituto de Genética Medica Jacinto Magalhães | 8091 | 8086 | 2538 | 3879 |
| 20 | 4228 | Instituto de Engenharia Eletrônica e Telemática de Aveiro | 3486 | 2301 | 2538 | 3879 |
| 21 | 2490 | Instituto de Engenharia de Sistemas e Computadores do Porto | 818 | 1624 | 998 | 3879 |
| 22 | 1829 | Instituto de Engenharia de Sistemas e Computadores | 1016 | 751 | 528 | 3879 |
| 23 | 3002 | Instituto de Desenvolvimento de Novas Tecnologias | 4605 | 2237 | 1124 | 3879 |
| 24 | 6314 | Instituto de Ciências Sociais da Universidade de Lisboa | 1077 | 7257 | 1388 | 3879 |
| 25 | 6185 | Instituto de Biologia Molecular e Celular | 3202 | 7367 | 572 | 3879 |
| 26 | 4025 | Instituto de Biologia Experimental e Tecnológica | 4008 | 4051 | 1601 | 3879 |
| 27 | 3277 | Instituto da Conservação da Natureza e das Florestas | 631 | 1147 | 2538 | 3879 |
| 28 | 690 | Champalimaud Centre for the Unknown | 3175 | 1554 | 529 | 981 |
| 29 | 5820 | Centro Internacional de Matemática | 6327 | 4466 | 2538 | 3879 |
| 30 | 3103 | Centro Hospitalar Lisboa Norte | 3576 | 7700 | 2250 | 857 |
| 31 | 2371 | Centro Hospitalar e Universitário de Coimbra (Hospitais da Universidade de Coimbra) | 3870 | 7340 | 1624 | 796 |
| 32 | 1773 | Centro Hospitalar de São João | 3675 | 3834 | 2538 | 930 |
| 33 | 5043 | Centro Hospitalar de Lisboa Ocidental | 6149 | 7708 | 2389 | 2431 |
| 34 | 2421 | Centro Hospitalar de Lisboa Central (Hospital Curry Cabral) | 1038 | 6746 | 2183 | 1123 |
| 35 | 6118 | Centro de Investigação Marinha e Ambiental | 7684 | 4658 | 2538 | 3879 |
| 36 | 5633 | Centro de Investigação e Estudos de Sociologia | 2910 | 4465 | 2538 | 3879 |
| 37 | 7079 | Centro de Estudos do Ambiente e do Mar | 831 | 6779 | 2538 | 3879 |
| 38 | 7469 | Centre for Research in Ceramics and Composite Materials | 1817 | 7291 | 2538 | 3879 |
| 39 | 4957 | Center for Neuroscience and Cell Biology Coimbra | 3219 | 3430 | 2538 | 3879 |
| 40 | 6480 | Association for the Institute of Biomedical Research on Light and Image | 5834 | 5503 | 2538 | 3879 |
